در آستانه جشن هالووین، ساکنان مزرعه Mossy Bottom خود را برای جشن آماده می‌کنند، اما خرابکاری ناخواسته کشاورز باعث از بین رفتن مزرعه کدوتنبل‌ها می‌شود. Shaun تصمیم می‌گیرد با انجام آزمایش‌های علمی مشکل را برطرف کند، اما اوضاع از کنترل خارج می‌شود. با ناپدید شدن کشاورز و ظاهر شدن موجودی مرموز در جنگل‌های اطراف، ماجراجویی تازه و پرهیجانی برای Shaun و دوستانش آغاز می‌شود.